Never Stop Exploring
Science
 With Us

Unleash the Power of Genomics: Massive Analyser®

Discover the World Inside You: MassBiome®

Unrivaled Efficiency, Unbeatable Value:
MobiomX®

Analysis of Anything
by anyone, anywhere

Who are we?

At Massive Bioinformatics, we’re a team of dedicated scientists, software engineers, and bioinformatics experts passionate about using bioinformatics and biotechnology to enhance the quality of life. We provide innovative, high-value products and services that advance health, science, and technology.

Holistic Approach

Our team of software engineers and bioinformatics experts develop advanced information systems that provide actionable insights and analysis programs for our customers.

Innovative Solutions

We leverage the latest biotechnology to develop groundbreaking solutions that solve real-world problems. Partnerships bring us together.

Privacy

As Massive Bioinformatics, we are committed to protecting our customers’ data. For this purpose, we invest in information security measures by adopting current practices in the sector. We ensure your data security by applying the principle of data minimisation in line with data collection and storage standards.

Contact us now!

From customized bioinformatics analysis and innovative software tools to Next Genereation Sequencing devices we provide everything you need to improve your research. Explore our services and products today. Contact us to schedule a meeting with our experts about your research projects. Together, we can make a difference.

Expert Consultancy

When you contact us, you can discover the most suitable solutions for your projects through one-to-one meetings with our expert consultants.

Customized Services

With services and products tailored specifically to your needs, we will accelerate your research processes and help you achieve your goals in less time.

Our Distributorships

Oxford Nanopore Technologies

Through the vision of “the analysis of anything, by anyone, anywhere” Oxford Nanopore Technologies (ONT) put forth a new generation of sensing technology. 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Molzym

Molzym offers ultra-clean, highly active amplification reagents and kits for microbial nucleic acid extraction. Their products are guaranteed to be free of contaminating microbial nucleic acids.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bento Lab

Bentolab is a portable biotechnology laboratory. It offers the possibility to perform DNA analysis, protein studies and other biotechnological processes in the field or in the laboratory. Ideal for education, research and industry.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Discover all our services

At Massive Bioinformatics, we provide comprehensive bioinformatics solutions to support your scientific research and data analysis needs. From genetic data analysis to bioinformatics consulting, we offer a world of knowledge you want to discover. We invite you to explore our tailored solutions and unlock your research potential!

Antimicrobial Resistance

Antimicrobial resistance (AMR) is a critical global health issue addressed through metagenomics, which examines resistomes in diverse microbial environments. Using Oxford Nanopore’s long reads, antibiotic resistance genes are identified in raw data through shotgun metagenomic and whole genome sequencing, leveraging the Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD).

16S – 23S Metagenomics

Metagenomics enables the assessment of microbial diversity and quantities within samples. While 16S rRNA gene identification at ~1500 bp is common, many modern sequencing methods use only a ~450 bp fragment, leading to inaccuracies. Oxford Nanopore’s long reading technology enhances species identification by reading the full 1500 bp gene, advancing the field. Metagenomic analyses offer extensive options for detailed exploration of diverse sample types or components.

Whole Genome Sequencing

Whole genome analysis involves a thorough study of an organism’s entire genome and its functional genes. This method detects variants – differences from the reference genome – along with antimicrobial resistance genes, secondary metabolite genes, and virulence genes in the annotated genome. It also includes tools like alignment images, circular genome depictions, genome comparison with close subspecies, polymorphism tables.

Amplicon Sequencing

Experience our Amplicon Sequencing Service—a tailored genetic analysis solution crafted to reveal precise insights from DNA or RNA samples. Through targeted amplification and sequencing of specific regions, we deliver focused, high-resolution data ideal for identifying mutations, uncovering genetic diversity, and tracing variations. Our state-of-the-art technology ensures precise outcomes, even with limited genetic material, enabling swift and cost-effective decision-making. Whether in medical advances or environmental exploration, our Amplicon Sequencing Service paves the way for efficient and impactful genetic analysis.

Next Generation Sequencing

Oxford Nanopore Technologies

PREPARE

$

SEQUENCE

$

ANALYSE

Featured in scientific publication

includes more than 2,000 patents and applications

amount of data that can be received at once with 48 flowcells

Our Blog Posts

Welcome to our Massive Bioinformatics Blog! You are in the right place to learn about the latest developments, innovative projects and in-depth analysis in the world of bioinformatics.

"; Massive Analyser ile Genomik Veri Analizi

Genomiğin Gücünü Ortaya Çıkarın:  Massive Analyser™

Biyoinformatik uzmanına gerek olmadan – Yükleyin ve Analiz Edin!

Tek ihtiyacınız olan bir tarayıcı.

Genomik verileri analiz etmek ve düzenlemek için bulut tabanlı bir platform. Germline ve somatik varyantları tespit eder, ACMG kılavuzlarına göre patojeniteyi sınıflandırır ve otomatik olarak klinik raporlar oluşturur. Klinisyenler için önceden ayarlanmış yapılandırmalar ve filtreleme seçenekleri sunar ve çeşitli düzenlemeler ve standartlarla uyumludur.

Upload & Analyse – without a Bioinformatician!

All you need is a browser.

A cloud-based platform for analyzing and organizing genomic data. It detects germline and somatic variants, classifies pathogenicity according to ACMG guidelines, and automatically generates clinical reports. Offers preset configurations and filtering options for clinicians, and is compliant with various regulations and standards.

 

 Varyantların Kopya Numarasını Saptar

 

FASTQ, BAM ve VCF Dosyalarından Germ Hattı ve Somatik Varyantları Tespit Eder

 

Örnek Başına İstatistiksel Bilgi Verir

 

 

ACMG Kılavuzuna Göre Varyantların Patojenitesini Otomatik Olarak Sınıflandırır

 

 

Aile Trio Analizleri ile de novo Varyantları Tespit Eder

 

 

Massive Analyser Raporlama Sistemi ile Klinik Raporları Otomatik Olarak Oluşturur

 

AVANTAJLAR

 IGV Özelliği

ACMG Kılavuzuna Göre Varyantların Patojenitesini Otomatik Olarak Sınıflandırır

Özelleştirilebilir Özellikler

Kendi varyant ve istatistik tablonuzu özelleştirin ve gelişmiş ayarlar menüsünden istediğiniz filtreleri uygulayın! Ayrıca patojenite, kural sütunlarını ve daha fazlasını özelleştirebilirsiniz.

Detaylı Çizelgeler ve Grafikler

Gelişmiş CNV ve Trio Analizleri için bile!

Sadece FASTQ Değil

BAM ve VCF’yi de girdi olarak yükleyebilirsiniz! (VCF bizim formatımızda yüklenmelidir.)

PİPELİNELAR

Exome

Trio

Advance CNV Detector

Nanopore

Platformumuz şu anda 4’ü ana pipeline (Exome, Trio, Advance CNV Detector, Nanopore) olmak üzere 8 farklı pipeline içermektedir. Ekzom pipeline, farklı başlangıç noktalarına sahip 3 alt pipeline’a sahiptir ve alt pipeline’ların her biri somatik veya germline olmak üzere iki seçeneğe sahiptir. Ortaya çıkan klinik ihtiyaçları karşılamak için pipeline sayısı zaman içinde artırılacaktır.

 

ÖRNEK TABLOLAR

Ana İstatistikler

Bu sayfa, hizalanmış verilerin globaller, kapsam, GC içeriği, gen tabanlı kapsam, eşleme kalitesi, uyumsuzluklar ve indeller, ekleme boyutu, zigosite oranı, tümör mutasyon yükü, Ts-Tv oranı gibi temel istatistiklerini içerir.

CNV Tablosu ve Çizimleri

Dağınık grafik, kromozomlar aracılığıyla kopya oranının 2 tabanı logaritmasını görselleştirir. Sıfırın altındaki belirli bir eşik değerinin altındaki bantlar kayıp anlamına gelirken, sıfırın üzerindeki bir eşik değerinin üzerindeki bantlar kazanç anlamına gelir. Noktalar tespit edilen CNV’nin güvenilirliğini gösterir. Nokta yoğunluğu yüksek ve nokta çapları büyükse, sonucun tekrarlanabilirliği de kabul edilebilirdir. Sonuçların güvenilirliğinden emin olmak için lütfen CNV tablosundan CNV ağırlığını ve log2 değerini kontrol edin.

CNV Diyagramı

Diyagram kromozom bazlı kopya sayısı varyantlarını göstermektedir. Koyu mavi kaybı gösterirken, koyu kırmızı kazancı gösterir.

CNV Grafiği

İstatistiksel Grafikler 

TEKNOLOJİK ÖZELLİKLER

NGS çıktısını herhangi bir manipülasyona gerek kalmadan doğrudan platformumuza yükleyin.
ISO/IEC 27001:2013, ISO9001:2015, ISO 14001:2015, ISO 45001:2018, ISO13485
GDPR ve KVKK uyumluluğu
Teknik Destek
Hasta analizi ve raporu için uygundur
FASTQ, BAM ve VCF dosyaları girdi olarak kabul edilir. (VCF dosyaları bizim formatımızda olmalıdır)
Varyant fraksiyonu (Genomik Fraksiyon Kapsamı olarak), zigosite durumu ve daha fazla istatistik verilir.
CES ve WES veri analizi ve incelemesi, fenotipe özgü varyant filtresini içerir.
Analiz ACMG varyant sınıflandırma kriterlerine göre yapılmıştır. (Ekzom ve trio analizleri, varyantların patojenite sınıfını belirlemek için otomatik olarak kanıtların 19 ve 20'sini sağlar).
CES ve WES veri analizi ve incelemesi, fenotipe özgü varyant filtresini içerir.
Varyantın popülasyon analizi için ExAC / ESP / 1000 Genomes /Gnomad kullanılır.
Grafik ve çizelgeler aşağıdakiler için verilmiştir; (ve daha fazlası)
  1. zigosite
  2. kromozomal pozisyon
  3. transkript üzerindeki etkiler
  4. otomatik patojenite hesaplaması
  5. sekans ontoloji bilgisi (çerçeve kayması, yanlış anlam vb.)
  6. dbSNP numarası
  7. Clinvar kayıtları
  8. Gen sembolü ve gen sembolü ile ilgili bağlantılar

Bizimle iletişime geç!

Özelleştirilmiş biyoinformatik analizler ve yenilikçi yazılım araçlarından Yeni Nesil Dizileme cihazlarına kadar araştırmanızı geliştirmek için ihtiyacınız olan her şeyi sağlıyoruz. Hizmetlerimizi ve ürünlerimizi bugün keşfedin. Uzmanlarımızla araştırma projeleriniz hakkında bir toplantı planlamak için bizimle iletişime geçin. Birlikte bir fark yaratabiliriz.

Uzman Danışmanlık

Bizimle iletişime geçtiğinizde uzman danışmanlarımızla birebir görüşmeler yaparak projeleriniz için en uygun çözümleri keşfedebilirsiniz.

Özelleştirilmiş Hizmetler

İhtiyaçlarınıza özel olarak tasarlanmış hizmet ve ürünlerle araştırma süreçlerinizi hızlandıracak ve hedeflerinize daha kısa sürede ulaşmanıza yardımcı olacağız.