Bahçenizdeki gölette yüzen koi balığı, dünyanın en küçük otostopçularını içinde barındırıyor olabilir. Geçtiğimiz yıllarda, koi ve Japon balığı gibi birçok süs balığı doğaya kazara, kasten ya da eğlence amaçlı balıkçılık kapsamında yasa dışı olarak bırakıldı.
Tüm balıklar, vahşi hayvanlar olarak parazit taşır. Genellikle başka bir ülkeye ithal edildiklerinde, balıkların bir dizi sağlık kontrolünden geçmesi gerekir. Ancak, tüketime yönelik olmayan süs balıkları bu kontrollerin dışında tutulur. Bu nedenle, mevcut popülasyonlar için risk oluşturan yeni parazit türlerini yanlarında getirebilirler. Egzotik süs balıkları doğaya kaçtıklarında, bu parazitler tüketim veya balıkçılık için yetiştirilen balıkları enfekte edebilir.
Su ürünleri danışmanı Dr. Bernice Brewster, Bento Lab ile DNA analizi gerçekleştirerek bu parazitleri tanımlamak için yeni ve güvenilir yöntemler geliştiriyor. Kingston Üniversitesi ve Birleşik Krallık Çevre Ajansı ile birlikte çalışan Bernice, yeni istilacı türlerin kaydını sağlıyor ve mevcut parazitlerin kaydını elektronik bir veritabanında tutuyor.
“Bu türleri tanımlamak için DNA analizini kullanmak harika. Benim için bir kapının kilidini açtı ve güvenli sonuçlar için yepyeni bir kapsam yaratıyor.”
Dr. Bernice Brewster
Solungaç Kurdu Tanımlamasındaki Zorluklar
Çiftlik balıkları soğukta daha az aktif oldukları kış aylarında balık göllerinde yeni stok oluşturmak için yeni yerlere taşınırlar. Çevre Ajansı taşınmadan önce balıkçıların bir sağlık taraması yapmasını şart koşar. Bu noktada, Bernice gibi araştırma uzmanlarına balık örnekleri teslim edilir ve analiz için parazit örnekleri alınır.
Bernice’nin şu anki araştırma odağı Dactylogyrus cinsine ait parazitler. Aynı zamanda solungaç kurdu olarak bilinen bu parazitler, solucana benzeyen küçük hayvanlardır. Balık konaklarına takılıp beslenmek için kullandıkları iki çift kancaları vardır.
![Işık mikroskopisinde solungaç kurdu ve kancalarının görüntüsü.](https://massivebioinformatics.com/wp-content/uploads/2024/07/bernice-brewster-solungac-kurdu-kancalar.webp)
Bu kadar küçük organizmalarla çalışırken, boyut türlerin doğru şekilde sınıflandırılmasında büyük bir zorluk olabilir. Solucan kurtlarını tanımlamaya yönelik standart bir yöntem ışık mikroskobudur. Bu yöntemde, kancalar ve üreme organları da dahil olmak üzere, belli tipteki parazitlere özgü özellikler görselleştirilir.
“Solungaç parazitleri yalnızca ışık mikroskobunun en uç noktasında görülebilir,” diye açıklıyor Bernice. “Sorun şu ki, bu minik hayvanların kendilerini doğru konuma yönlendirmeleri gerekiyor. En ufak bir hareket bile işi çok zorlaştırabilir.”
Bento Lab’ın Solungaç Kurdu Çözümü
Mikroskopinin yarattığı zorluklarından üstesinden gelmek için Bernice, Kingston Üniversitesi ile birlikte solungaç kurtlarının DNA’larının tanımlanması için yeni bir yöntem geliştirdi. Örneklerden DNA ekstraksiyonuyla başlayan Bernice, PCR ile devam edip ardından jel elektroforeziyle PCR ürününü doğruluyor. PCR ürünü, dizileme için Dundee Üniversitesine yollanıyor. Bernice elde edilen diziyi aldıktan sonra kodu Genbank’ta tanımlıyor.
![](https://massivebioinformatics.com/wp-content/uploads/2024/07/bernice-brewster-solungac-kurdu-dna-barkodlama.webp)
Aquatic Consultancy‘nin yöneticisi olan Bernice, Birleşik Krallık’ta balıkçılık endüstrisinde çalışan pek çok bağımsız biyologdan biridir. Bento Lab, serbest çalışan bir bilim insanı olan Bernice’in iş akışına mükemmel bir şekilde uyuyor.
“Bento Lab’dan gerçekten çok memnunum. Solungaç kurtlarım için 3 PCR programım var. Jel düzeneği, DNA’yı çıkardığımı ve temiz bir numune aldığımı kontrol etmek için harika.”
Gelecekte Bizi Neler Bekliyor?
Bu yılın başlarında projeye başladıklarından beri, Bernice ve ortakları Birleşik Krallık’ta henüz belgelenmemiş iki veya üç türü tespit etti. Bernice, bu türlerden bazılarının ülke için yeni bile olabileceğinden şüpheleniyor, ancak referans olarak mevcut bir temel olmadan bunu kanıtlamak mümkün değil.
Bu çalışmanın önemli bir sonucu, Bernice ve diğer araştırmacıların ülkede hangi türlerin var olduğuna dair sağlam bir temel oluşturmalarına olanak tanıyan güvenilir bir süreçtir. Bu, gelecekte hastalıkların kontrol altına alınmasında önemli bir etkiye sahip olacaktır.
“Birleşik Krallık’ta, balık hareketlerini, hangi türlerin nereye taşındığını kontrol etmek önemlidir. DNA analizini kullanarak bir temel oluşturmak, yetkililerin belirli parazitlerin ve hastalıkların yayılmasını nasıl kontrol ettiğini belirlemede potansiyel sağlayabilir.”
Bento Lab ile çalışmalarınızı her yere taşımak için bize ulaşın!